最早发现自闭症儿童饮食治疗的是自闭症孩子的父母，他们在孩子的平时饮食中，发现他们的孩子吃了某些特定的食物后状况会恶化。虽然对每一个自闭症孩子产生影响的食物都不一模一样，但有几类食物却是一同的。研究显示，蛋白质有非常长的链，这类链由很多叫做氨基酸的小单位组成。当蛋白质被消化后，它将分解成各种氨基酸。然而，有的蛋白质未被完全分解，形成了短钛链。其中有的短钛链具备鸦片活性，它们能模仿人脑中自动产生的脑内啡有哪些用途，这种脑内啡含有吗啡因，可以刺激人脑的中枢神经系统。当过量的带有鸦片活性的短钛链穿过消化肠进入血液，再穿过脑血屏障进入大脑后，它们就可能影响人的整个中枢神经系统，最后致使人体的进步受损，机体功能失调。
饮食治疗最简单的办法之一就是在自闭症孩子所吃的食物中去除那些有影响的食物，可坚持6-12个月，具体如下：
1.类食物
大家所说的谷类食物主要指大麦、燕麦和黑麦等制成的食物，不包含大米和土豆等大家常常食用的食物。因此，自闭症儿童的父母应注意尽可能防止给孩子食用诸如黑面包、燕麦片、面食类之类的东西。
2.蛋白食物
因为自闭症孩子没办法彻底分解牛奶中的酪蛋白，导致消化道内带有鸦片活性的短钛链增多，从而影响他们的症状，因此，控制自闭症孩子不吃或尽可能少吃奶制品对他们来讲是有利的。此外，还有鸡蛋、鲜奶蛋糕、奶酪、冰激凌、酸奶等食物也同样富含酪蛋白，父母应该控制其孩子对这类食物的摄入。值得提出的是，因为牛奶含有丰富的营养，因此父母在控制这类食物的同时，应注意补充各类替代品，如豆奶或蔬菜等。
3.色素的食物
硫酸盐对人体的消化功能有着很用途。假如人体的胃肠道内缺少硫酸盐，那样消化道的可同透性就会增加，携带鸦片活性的钛就容易进入血液，自闭症儿童病人的症状也将变得恶化。因此，在消化过程中，任何需要用硫酸盐的食物都不利于自闭症儿童病人的好转。无论是天然的还是人工合成的色素食品，在人体内消化时都需要硫酸盐，这类食品包含巧克力、橘子汁、彩色泡泡糖等。因此，这类食物应尽可能防止给孩子吃。
4.水杨酸盐食物
含水杨酸成分高的食物对自闭症儿童病人有不好的用途。由于水杨酸对人体的胃肠道有紧急的负用途，会致使消化道的可通透性增加，这类食物包含橘子、橙、胡柚、柠檬、番茄等。值得提醒父母的是，阿司匹林也含有大量的水杨酸。因此，父母不只应注意尽可能防止给孩子吃这种食物，在孩子感冒发烧时也尽可能不要用阿司匹林。
在控制上述4类食物后，父母还可依据自己孩子对食物的不同反应来选择其他的食物加以控制。如有的自闭症孩子食用牛肉和茄子后会有不好的的情绪或行为反应。拟定一份记录表，写下你的孩子天天所吃的食物和当日情绪、行为表现，察看3-6个月，看自闭症孩子的症状有无好转，或有助于你找到这类特定的，对你孩子有影响的食物。
很多疾病都直接源自氨基酸摄入的不平衡。有关专家发现自闭症孩子的血液里谷氨酸的水平较低，补充适当的谷氨酸对这类孩子能有所帮助。在医学上谷氨酸被常常用作促进消化壁绒毛的成长，因此，它可以改变消化道的吸收功能。假如大家的消化道内缺少消化酶，那样大家就没办法充分分解短钛链。研究表明。从凤梨中提取的酶对自闭症孩子的治疗有成效。绿叶菜是碱性，可中和饮食中糖、肉、蛋及代谢中产生的过多酸性物，可清除血中的毒物素。自闭症儿童病人平时多吃粗粮、绿叶菜，有益于身心康复。如：萝卜、青菜、油菜、菠菜、介蓝、大白菜、胡萝卜、菜花、橄榄等。粗粮：红薯、土豆、玉米、荞麦等。水果：果汁、甘蔗、青梅、苹果、香蕉等。
饮食治疗只不过自闭症孩子治疗办法之一，父母应当结合其他疗法，对自闭症孩子进行全方位综合的治疗。但，因为现在科学家对自闭症儿童的成因仍无确切的定论，因此，所有这类治疗都尚处于探索阶段，还没出现能完全治愈自闭症儿童的特效药。对于自闭症儿童，父母还是应该花更大的努力在教育和练习之上。